聖多默宗徒堂座落於香港西面的青衣島。青衣是香港第五大島嶼，面積10.69平方公里，人口約20萬。

由於都市化發展迅速及人口增多，1982年，青衣的信友團體脫離荃灣堂區，成立聖多默宗徒準堂。1993年，聖多默宗徒堂正式成為堂區，並開始籌備興建聖堂。1996年11月24日，聖堂地盤舉行奠基禮，1999年7月4日，新聖堂落成祝聖啟用，為青衣及青衣堂區帶來新的氣象。

現存放於聖多默宗徒堂的聖多默聖髑，是1995年籌備建堂時，由歐陽輝神父致函意大利Ortona 的主教Enzio D'Antonio，獲其批准送贈的珍貴聖物。